Nel santuario di Cnosso vi erano varie sale dedicate al culto. Dalla sala del trono, con affreschi rappresentanti grifoni, si accede a un bacino lustrale destinato alle abluzioni purificatrici, mentre nelle cripte ipostile si svolgevano le cerimonie di culto. Vicino si trova il tesoro dove furono rinvenute le famose Dee dei serpenti, esposte al museo di Iráklio.