La chiesa di San Michele in Isola è immediatamente visibile, non appena arrivati sull'isola-cimitero. Costruita in pietra bianca istriana da Mario Codussi, è la prima chiesa rinascimentale di Venezia. Purtroppo, per motivi di sicurezza, è vietato l'accesso al sagrato e la sua luminosa facciata è visibile solo dal mare. Si entra dal lato che si affaccia sul piccolo chiostro, a sinistra dell'ingresso del cimitero. All'interno, la navata centrale è sormontata da un sontuoso soffitto a cassettoni.