Questo museo ecclesiastico riunisce opere di grande valore storico ed artistico. Fra i tesori, segnaliamo la teca di Sant'Isidoro (XI sec.), cofano in legno placcato d'oro e d'argento inciso a sbalzo; il calice di Doña Urraca, composto da due coppe romano-orientali in onice; e il cofanetto smaltato (XII sec.), composto da 17 pannelli in rame ricoperti di smalti di Limoges. La biblioteca conta 800 pergamene, 400 incunaboli fra cui una bibbia mozarabica del 960, 1055 volumi antichi e rari che spaziano dal XVI al XVIII sec.