Il museo celebra la storia culturale e artistica della regione, con collezioni di arte indiana della West Coast, manufatti dei pionieri e reperti di storia naturale. Il museo è ospitato in un complesso di quattro edifici, di cui il principale è un singolare palazzo vittoriano turrito in mattoni rossi, sormontato da un campanile (1892), che un tempo fungeva da municipio. Nel 1992 il museo accorpò altri due edifici e prese in gestione il Whatcom Children's Museum. Le gallerie del primo e secondo piano sono dedicate a mostre di arte e fotografia contemporanee. Il terzo piano espone la collezione di abiti, giocattoli, oggetti antichi e altri ricordi della storia locale, oltre che i meccanismi che regolano il Tosco Tower Clock ora installato nel campanile. Il Syre Education Center (201 Prospect St.) ospita una mostra permanente di utensili indiani, bauli e cestini realizzati da indigeni "Prime Nazioni" della costa occidentale (per lo più Lummi e Coast Salish) e dell'Alaska (Aleuti ed Eskimo), e mostre che ripercorrono la storia e le attività del Nord-Ovest. Considerata parte del Whatcom campus, la vicina ARCO Exhibition Gallery (206 Prospect St.) ospita imporanti mostre di arte e di storia, mentre il Whatcom Children's Museum (227 Prospect St.) è dedicato ai bambini dai 2 agli 8 anni.