Per i musulmani, Ajmer fu, sin dal XIII sec., un importante centro religioso. Questa enclave musulmana all'interno di una regione rajput possiede quindi numerose moschee con bei minareti che svettano verso il cielo. Quella di Adhai-din ka Jhonpra, costruita sul sito dove si trovavano santuari giainisti, oggi in rovina, è un perfetto esempio dell'architettura indo-musulmana. L'edificio vale la visita per la sala di preghiera con cinque cupole, dotata di una bellissima facciata con sette arcate ricoperte di versetti coranici.