Inaugurato nel 2006, il Museo Imhotep presenta il sito di Zoser, la sua storia e il lavoro degli archeologi che hanno effettuato le ricerche sul complesso funerario. Una sala è dedicata all'archeologo Jean-Philippe Lauer che ha votato la sua vita al sito di Saqqara e chi dobbiamo l'iniziativa dell'apertura di questo museo. Le altre sale espongono numerose tombe e mummie scoperte nella regione, nonché stele, statuette e sarcofagi riportati alla luce durante gli scavi nella necropoli.