Situato nell'austero palazzo Castellani, di epoca medievale, questo museo possiede un ricchissimo insieme di strumenti scientifici antichi. Gran parte di questi pezzi provengono dalle collezioni dei Medici e dei granduchi di Asburgo-Lorena che, da seguaci dell'Umanesimo interessati a tutti i campi della scibile umano, si appassionarono alle scienze già in epoca rinascimentale. Si notino, in particolar modo, i ricordi di Galileo (lenti, telescopi, compassi).