Il museo è stato inaugurato nel 2000 per i 500 anni della fondazione della Santa Casa della Misericordia, un'istituzione di carità a carattere religioso, e ospita nelle prime due sale e nel corridoio vari oggetti appartenuti alla confraternita. Da notare soprattutto i pannelli di ceramica rinascimentale e quelli del XVIII sec. e i ritratti dei benefattori.